他是明朝“四大高僧”之一，梦中得菩萨指引，后留下不腐肉身

憨山大师七岁即对生死来去存疑，九岁能诵《普门品》，十二岁即辞亲投南京报恩寺，意欲出家，住持西林和尚见他聪颖，请人教他读《法华经》，以及《四书》、《易经》和诗赋。

十九岁时决意出家，赴摄山栖霞寺云谷法会，并读《中峰广论》，开始学禅；同年又从无极明信法师听讲《华严玄谈》，并受具足戒；因仰慕唐清凉澄观大师，故自号“澄印”。

大师二十六岁时，觉得南方气候温暖和熙，不利于"病自磨砺"，毅然北上京师，自入冰雪苦寒之地，锻炼意志，刻意禅学。他先后参华严宗师遍融真圆大师和禅门耆宿笑岩德宝禅师等，请示禅要，并听讲《法华》、唯识诸经。

万历四年(1576年)，莲池大师游五台山，憨山大师特意赶往晤谈，深受莲池大师禅净兼修思想的影响，日后极力提倡禅净双修，晚年尤甚。

万历十四年，明神宗把《大藏经》十五部送给天下名山寺庙，太后将其中一部送给正在东海牢山（青岛崂山）的憨山大师，朝廷在牢山建立海印寺，特请大师住持。

万历二十三年，因所谓私修庙宇获罪，被充军到广东雷州，官民慕德亲近，大师便以罪犯服装登座为众说法，创开岭南的佛教风气。

万历二十八年秋，南韶长官祝公请大师入曹溪，当时南华寺衰落已久，他到寺后，开辟祖庭、选僧受戒，设立僧学、订立清规，一年之间，百废俱兴。