在佛法中眼又表示智慧，五眼（肉眼，天眼，慧眼，法眼，佛眼）即表示佛具足人、天、二乘、菩萨和佛一切的智慧。
关于五眼，《华严经》中说道：“肉眼见一切色故，天眼见一切众生心故，慧眼见一切众生诸根境界故，法眼见一切法如实相故，佛眼见如来十力故。”
梁武帝时代的傅大士也有颂：“天眼通非碍，肉眼碍非通，法眼唯观俗，慧眼直缘空，佛眼如千日，照异体还同，圆明法界内，无处不含容。所谓“五眼”，眼是总名，从其功用分别，则有五种不同。
肉眼
肉眼为由父母气血所成，能见色相之眼，肉眼有色质的障碍，是凡夫经由父母所生的身体上具有的。因有色质障碍，能见的距离与范围都相当有限，见近不见远，见前不见后，见内不见外，见昼不见夜，见上不见下。太小、太大、太远、太近，均非肉眼所能见，或太过黑暗或强烈的光度，也非肉眼所能适应。藏传佛教的肉眼也指能识别一切形色或能确切识别一百至三千由旬之间所有一切事物的智慧。顾名思义，是诸天所具之眼，从修禅定而得。因为没有色质障碍，能于物质世界中自在地观察，而不受距离、体积、光度的限制。天眼是天趣众生或由禅定境界而得的眼，远、广、微细事物皆能得见。《大智度论》卷三十三云：得是天眼远近皆见。前后、内外、昼夜、上下悉皆无碍。是天眼见和合因缘生假名之物，不见实相，所谓空、无相、无作、无生、无灭。如前，中后亦尔，为实相故求慧眼。天眼能照见十方众生的前生后世、投生何处，全部都能一一现见。慧眼是声闻、缘觉二乘修行之人所证得的。因为他们对四谛、十二因缘的修学与证悟，所以能出生死轮回，不受身心世界的束缚，离五蕴、出三界。这和世间一般人所说“慧眼识英雄”、“慧眼独具”的功能，显然不同。世人所说的“慧眼”只是世间智慧，尚存有“我”的观念，不过比较深澈、明锐、敏捷；而阿罗汉、辟支佛所具的慧眼则是无我、无执的。法眼为初地以上的菩萨所具，能见万法的本性，亲证诸佛法身之一分，乃至多分，绝不是如一般人所说的具有法术之士就是具有法眼。法眼和证法身有关，若是仅仅见性，尚不能称为具足法眼，而只能够确信法眼的存在和法眼的功能。法身遍一切处、遍一切时，它非色、非无色，非有相、非无相，非非有相、非非无相；说是，一切都是，也可说一切都不是。有执着者，一切都不是；无执着者，一切都是。具足法眼的菩萨，称为法身大士，非凡夫所能想象。佛眼，具足前面四种眼的所有功能，无所不见、无所不知。如人见极远处，佛见则为至近；人见幽暗处，佛见则为显明。佛眼是智慧的全体，也就是佛陀大圆镜智的本身，又称为大圆觉，也称为无上菩提。我们引证南北朝时南朝一位大德—傅大士所作的偈诵，作为五眼功用的总结。文殊师利勇猛智 普贤慧行亦复然
我今回向诸善根 随彼一切常修学
三世诸佛所称叹 如是最胜诸大愿
我今回向诸善根 为得普贤殊胜行
愿所有众生都能离苦得乐
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